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Das KoKoNat kooperiert eng mit der Praxis für Japanische Medizin in München (Dr. H. Reißenweber-Hewel, gleichzeitig Präsidentin der „International Society for Japanese Kampo Medicine ISJKM“). Mit Unterstützung des KoKoNat wurden zwei internationale Symposien von dieser Fachgesellschaft abgehalten (25.11.2011 am Klinikum rechts der Isar und 10.04.2013 als Satellitensymposium der ‚International Conference for Complementary Medicine Research‘ in London).

Die Kooperation umfasst auch Vorlesungen am Klinikum rechts der Isar zu spezifischen Themen der Kampo-Medizin sowie Planungen klinischer Studien mit pflanzlichen Substanzen der japanischen Arzneimitteltherapie.